3ª fase: 11/04/2014 – Buscas na sede da Petrobras
Entre 25 mandados cumpridos na terceira etapa da operação — incluindo buscas, conduções coercitivas e prisões temporárias —, ganhou destaque uma ação realizada na sede da Petrobras, no Rio de Janeiro. A própria presidente da estatal na época, Maria das Graças Foster, se dispôs a receber os policiais federais e entregar documentos solicitados pela Justiça.